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加速新冠肺炎药物研发,BAT 滴滴向科研机构免费开放 AI 算力

发布时间:2020-02-05 08:54:43 所属栏目:站长百科 来源:站长网
导读:跟着中国疾控中心乐成疏散出新型冠状病毒,人们对该病毒的熟悉越来越深,相干的疫苗和殊效药的研发也在紧锣密鼓地举办中。然而,这一进程必要大量的数据说明、文献筛选和超算事变支撑。 为了进一步加速新疫苗、新药的研发和上市,海内浩瀚科技公司纷纷向科

跟着中国疾控中心乐成疏散出新型冠状病毒,人们对该病毒的熟悉越来越深,相干的疫苗和殊效药的研发也在紧锣密鼓地举办中。然而,这一进程必要大量的数据说明、文献筛选和超算事变支撑。

为了进一步加速新疫苗、新药的研发和上市,海内浩瀚科技公司纷纷向科研机构免费开放本身的 AI 算力。

阿里云

2020 年 1 月 29 日晚间,阿里云公布在疫情时代向环球民众科研机构免费开放统统 AI 算力。

阿里云高机能计较团队认真人何万青表明道:

凡是来说,一款药物的研发必要颠末毒株疏散、测序说明、找到病毒的靶点举办辨认和验证、探求对应化合物、评估研究和动物尝试、制剂合成、临床试验以及上市等步调。

总而言之,药物研发的进程都必要投入大量的款子、人力以实时刻。据相识,在美国研发一种新的药物,从这个研发项目启动到其最终通过 FDA(Food and Drug Administration,美国食物药物监视打点局)的核准,均匀必要耗费 10 -15 年时刻,耗资高出 13 亿美元。

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研究职员对新型冠状病毒举办毒株疏散

今朝,本次新型冠状病毒疫苗和殊效药的研发已经完成了毒株疏散以及基因测序,这一部门事变首要是在尝试室举办研究事变;而接下来的研发,包罗对病毒靶点举办辨认和验证、探求对应化合物等,都必要云计较的辅佐。

何万青对媒体说道:

出格是探求对应化合物,必然要挪用超大局限算力,由于可供制成药物的化合物有 5000-15000 种。要先从错乱的化合物中找到针对病毒吻合的“袭击偏向”,再举办合成和拼接,假如都要从尝试室里逐一比对,那就太挥霍时刻了。

在阿里云这次开放 AI 算力之后,环球民众科研机构无需“列队”,随时可以在弹性伸缩、数据交换和宣布都越发便捷的协怜悯形中事变。

其它,在筛选医学文献和说明汗青数据时,AI 算力也能派上用场。此前相同的 SARS 等疫情发作后,医学界留有大量的汗青药物研发以及临床数据,尚有许多医学文献散落环球各地,这些都也许成为这次新型冠状病毒治疗打破口。

腾讯

2020 年 1 月 30 日,腾讯官方公布向北京生命科学研究所/清华大门生物医学交错研究院的黄牛传授尝试室、中山大学药学院的罗海彬传授团队提供免费的运超算手段、运算集群支持以及基本的云计较手段;同时创立应急事变小组,辅佐加快疫苗研发和新药筛查。

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上述两个由腾讯提供算力支持的团队正包袱新冠肺炎的药物筛选和病毒突变猜测事变。

早前,国度科技部紧张启动了相干的应急研究项目,中山大学药学院罗海彬传授团队入选了“2019-nCoV的掩护性抗体、疫苗研发和药物筛选与评价研究”的课题,认真遴选具有治疗浸染的候选药物等事变。

为此,腾讯云敏捷调治了一批 GPU 处事器节点,并为罗传授团队开通了高机能计较账号,免费提供全部计较资源,支持罗传授的团队举办抵挡新型冠状病毒的药物筛选和病毒突变猜测。

同时,北京生命科学研究所/清华大门生物医学交错研究院黄牛传授尝试室, 正在推进基于新型冠状病毒靶标布局的化合物假造筛选的事变。

腾讯为此提供了大量尺度的 CPU 算力以及工具储存手段,辅佐黄牛传授尝试室举办基于布局的药物分子计划的离线计较使命。针对新型冠状病毒的多个靶点,黄牛传授尝试室通过腾讯云秒级交付的海量高机能计较、存储资源,快速计较筛选数亿级此外化合物数据库,团结尝试验证,来探求新型布局范例的先导化合物,为下一步新药研发事变提供依据。

总而言之,腾讯云较强的 CPU 以及 GPU 算力调治手段可觉得基因测序、医疗工程提供不变高效的算力支持,从而低落创新药物前期研发的本钱与周期。

百度

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紧随阿里和腾讯的脚步,百度研究院也在 2020 年 1 月 30 日公布,将向各基因检测机构、防疫中心及全天下科学研究中心免费开放线性时刻算法 LinearFold 以及天下上现有最快的 RNA 布局猜测网站,以晋升新型冠状病毒 RNA 空间布局猜测速率,从而助力疫情防控。

详细来说,2019 年 7 月,百度初次提出 LinearFold 算法,该算法让整序列、整基因组的 RNA 布局猜测成为也许,也是 RNA 布局猜测规模的一次重大打破。

此次引起武汉肺炎的新型冠状病毒与 SARS 病毒、艾滋病毒、埃博拉病毒、流感病毒一样,都属于 RNA 病毒,其单链布局导致病毒更轻易变异、不易开拓疫苗。但假如医学专家们可以或许越发快速且深入地相识新冠肺炎基因组的性子,这将为针对性药物的计划研发提供重要信息。

传统上,RNA 二级布局猜测必要三次方时刻伟大度的算法。好比说,序列长度翻一倍就要支付 8 倍的计较时刻,像 RNA 病毒基因组这样的超长序列(譬喻,艾滋病毒有约 1 万个碱基,埃博拉病毒有约 2 万个碱基)必要很长一段守候时刻。而冠状病毒(包罗非典病毒和这次的新型冠状病毒)的基因组又是全部 RNA 病毒里最长的,长达 3 万个碱基,最快的经典算法也必要 55 分钟。

不外,通过百度 LinearFold 算法,这一计较时刻被压缩到了 27 秒,相等于晋升了 120 倍。与此同时,百度还向环球科学家免费开放了其 RNA 布局猜测网站。这些都将晋升基因检测、疫苗研发等科研中心的事变服从,让病毒的研究及疫苗开拓速率快速进步。

值得一提的是,在此之前,百度还公布创立总局限 3 亿元疫情及民众卫生安详攻坚专项基金,用于支持新型冠状病毒肺炎等新疾病的治愈药物筛选、研发等一系列抗击疫情事变。

滴滴云

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注:图片来自滴滴云

2020 年 2 月 1 日,滴滴也插手了 BAT 的队列——滴滴云公布,在通力保障正常处事的基本上,创立应急战疫小组,并免费向海内科研机构、医疗及抢救平台等开放用于抗击疫情相干事变的 GPU 云计较资源和技能支持,包罗但不限于 GPU 云处事器、负载平衡 SLB、弹性公网 EIP 等以及相干的技能支持处事。


(编辑:河北网)

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