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基于深度学习的成像技术FLI-Net

发布时间:2019-11-20 01:51:09 所属栏目:运营 来源:站长网
导读:2019年11月13日,伦斯勒理工学院的研究职员开拓了一种称为FLI-Net的深度神经收集新技能,该技能运用深度进修对荧光寿命成像发生的图像举办量化。 恒久以来,分子成像一向是研究职员相识也许导致临床应用的生物学根基因素的有用器材。详细而言,荧光寿命成

2019年11月13日,伦斯勒理工学院的研究职员开拓了一种称为FLI-Net的深度神经收集新技能,该技能运用深度进修对荧光寿命成像发生的图像举办量化。

恒久以来,分子成像一向是研究职员相识也许导致临床应用的生物学根基因素的有用器材。详细而言,荧光寿命成像(FLI)提供了一种无创搜查样品的要领,以得到对细胞微情形的奇异看法。FLI可用于量化体内的卵白质之间的彼此浸染以及生物传感器活性配体与受体的团结。可是,这种间接成像要领必要回收迭代优化的后期网络处理赏罚来说明数据集。这极大的增进了体系的范围性。

传统上,说明这些数据必要大量时刻和伟大的数学器材,这些器材严峻依靠于用户,这使得难以天生同等且可重现的图像。这些坚苦已成为在临床情形中行使该技能的障碍。

基于深度进修的成像技能FLI-Net

研究团队开拓了3D卷积神经收集(CNN),专门用于处理赏罚FLI体系的数据。该体系不必要任何用户界说的参数输入。

另外,可以行使合成数据天生器有用地对其举办实习,并通过尝试数据集举办验证,从而无需通过尝试获取大量的实习数据集。CNN可以处理赏罚通过时代相干单光子计数(TCSCP)或基于门控ICCD的仪器(最常见的FLI技能)得到的尝试荧光衰减。3D CNN“ FLI-Net”旨在模仿行使卷积运算和非线性激活函数层的曲线拟合要领,使得在3D数据立方体(x,y,t)中输入时刻和空间鉴另外荧光衰减,并在每个像素处预计双指数参数(两个寿命和一个分数幅度),以提供输出与输入(x,y)尺寸沟通的图像。

为了测试FLI-Net,研究职员行使FLI对癌细胞举办成像以可视化活细胞的代谢状态,并操作福斯特共振能量转移(FRET)以丈量细胞中受体的参加程度。研究小组发明,深度神经收集的机能与今朝行使的贸易软件一样好,而且在某些环境下要优于贸易软件。另外,他们还发明,该技能必要较少的光才气天生具体的图像。

基于深度进修的成像技能FLI-Net

伦斯勒(Rensselaer)率领这项研究的生物医学工程学传授Xavier Intes说:“我们提供的器材将越发得当最终用户,这不只是生物学家,还包罗外科大夫。”

研究职员发明,FLI-Net系统布局很是得当图像形成典型。因此,他们的深度进修框架可以用作伟大荧光寿命成像进程的免拟合说明的通用新器材。

伦斯勒(Rensselaer)生物医学工程学助理传授潘平坤说:该研究的目标是将FLI的益处作为准确医学的要害器材带入临床,这是很多临床应用中的技能。譬喻,它可用于体内及时成像肿瘤,这可以辅佐外科大夫在手术进程中看到病变,从而使他们可以或许以最小的侵害来完全破除癌组织康健组织”。

(编辑:河北网)

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